肛瘘的主要病理改变是肛管很少累及直肠。肛管和肛周皮肤之间有一条感染管道。它们通常有两个口,一个是靠近直肠壁的内口,另一个是长时间不愈合的肛周皮肤上的外口。
肛瘘是由一般化脓性感染引起的,少数是结核感染,也有其他特殊感染,如克罗恩病溃疡性结肠炎,这是比较少见的。直肠继发感染和肛门外伤也可形成肛瘘。
此外,直肠癌和肛管癌的破裂也可形成瘘口形成肛瘘,这些比较少见。一般来说,感染性化脓性感染引起的肛瘘有显著差异。肛瘘的常见表现是反复有少量脓液流出外口。
脓会刺激肛门周围的皮肤。当眼睛闭上时,肛门周围的皮肤会感到发痒。