霉菌性阴道炎在临床上治疗方法很多，由于霉菌性阴道炎有易复发性，所以治疗起来也相对困难一些，首先要改变阴道的酸碱度，因为霉菌在酸性环境中，迅速生长大量繁殖，而在碱性环境中，就会抑制霉菌的生长，所以首先用5%的碳酸氢钠冲洗阴道，然后再用治疗霉菌的栓剂，比如说凯立丁4天1次，连续用两粒可以杀灭阴道内的念珠菌。

另外，对于复发性的霉菌性阴道炎，除了外用药物之外，还需要口服氟康唑胶囊，并且性伴侣同时治疗。